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孟德尔随机化教程

因果推断的遗传学方法

如何用GWAS数据做因果推断?F统计量怎么算?MR-PRESSO、Steiger检验是什么? 本教程系列基于真实科研案例,帮你掌握MR分析的完整流程。

4+
精品教程
50+
代码示例
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📚
学习提示: 本教程内容仅供学习参考,实际应用时请结合具体数据和场景进行调整。 代码和方法可能需要根据实际情况进行修改。

🗺️ 学习路线

📚
基础概念
🔬
TwoSampleMR
质量控制
📊
高级分析

📚 全部教程

01

孟德尔随机化完整教程

实战

从GWAS数据到因果推断:TwoSampleMR完整流程,F统计量计算、MR-PRESSO、Steiger检验全套代码

📖 阅读时间:25分钟 💻 代码示例:20+
02

中介MR分析

高级 筹备中

暴露→中介因子→结局:完整中介分析流程,Bootstrap置信区间计算

03

多变量MR(MVMR)

高级 筹备中

同时分析多个暴露的因果效应:调整混杂因素,识别独立因果效应

04

MR结果可视化

基础 筹备中

森林图、漏斗图、散点图:用R语言绘制发表级MR结果图表

📦 前置准备

📦 R包安装

install.packages(c(
  "TwoSampleMR",
  "MRPRESSO",
  "data.table",
  "dplyr",
  "openxlsx"
))

🗂️ GWAS数据来源

  • IEU OpenGWAS Project
  • GWAS Catalog
  • UK Biobank
  • FinnGen

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  • 📄 Sanderson E et al. 2022 IJE
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