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学习提示:
本教程内容仅供学习参考,实际应用时请结合具体数据和场景进行调整。
代码和方法可能需要根据实际情况进行修改。
🗺️ 学习路线
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基础概念
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TwoSampleMR
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质量控制
📊
高级分析
📚 全部教程
01
孟德尔随机化完整教程
实战从GWAS数据到因果推断:TwoSampleMR完整流程,F统计量计算、MR-PRESSO、Steiger检验全套代码
📖 阅读时间:25分钟
💻 代码示例:20+
02
中介MR分析
高级 筹备中暴露→中介因子→结局:完整中介分析流程,Bootstrap置信区间计算
03
多变量MR(MVMR)
高级 筹备中同时分析多个暴露的因果效应:调整混杂因素,识别独立因果效应
04
MR结果可视化
基础 筹备中森林图、漏斗图、散点图:用R语言绘制发表级MR结果图表
📦 前置准备
📦 R包安装
install.packages(c( "TwoSampleMR", "MRPRESSO", "data.table", "dplyr", "openxlsx" ))
🗂️ GWAS数据来源
- ✓ IEU OpenGWAS Project
- ✓ GWAS Catalog
- ✓ UK Biobank
- ✓ FinnGen
📖 推荐阅读
- 📄 Bowden J et al. 2015 IJE
- 📄 Sanderson E et al. 2022 IJE
- 📄 Hemani G et al. 2018 Nat Genet